Kundenspezifische Anwendungen erfordern die Entwicklung von speziellen Funktionen für ein HSM, das für solche Anwendungen nach entsprechenden Kriterien auszusuchen ist. Die Kriterien betreffen in der Regel die kryptografischen Fähigkeiten und die Leistung, die erforderlichen Zertifizierungen, die Programmierbarkeit bzw. den Preis einer kundenspezifischen Anwendung (siehe auch Bedarfsanalyse ), und nicht zuletzt den Support.